机舱、泵舱的涂装一般分为二部分，一是最底层的花铁板以上部分，即舱壁部位，要求涂料能防锈、防油，容易清洁和装饰性好，不易泛黄。因此，此部位涂料采用常规涂料系统，可按照生活舱舱壁的涂装配套方案。涂装2道铁红环氧酯或醇酸底漆，再涂装2道浅色醇酸面漆，总厚度不得低于120μm。
花铁板以下部位，即舱底部位可能积聚污染的水、油污、含酸的润滑油等，且不易清理修补，腐蚀环境极为恶劣。舱底部位的涂料主要作用是防腐，美观是次要的，要求耐油、耐水、耐酸、附着力强等。涂装方案可按照压载水舱或油舱的涂料配套体系进行施工。以干膜200μm以上的环氧沥青涂料、纯环氧涂料最为常用。
近年来，由于造船时新技术的应用，加大了长效防腐蚀的首次投入，而减少了维修周期。在腐蚀严重的机舱底部，造船时采用在钢板上热喷涂锌（铝）的技术，涂刷封孔涂料后，再涂装配套环氧或环氧沥青涂料，防腐寿命大大延长。对舱壁，随着无溶剂或水性涂料的应用，将逐步使用无毒低溶剂挥发的绿色涂料。
